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加快打造原始創新策源地，加快突破關鍵核心技術，努力搶占科技制高點，為把我國建設成為世界科技強國作出新的更大的貢獻。

——習近平總書記在致中國科學院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經濟主戰場、面向國家重大需求、面向人民生命健康，率先實現科學技術跨越發展，率先建成國家創新人才高地，率先建成國家高水平科技智庫，率先建設國際一流科研機構。

——中國科學院辦院方針

中國科學院上海微系統與信息技術研究所
中國科學院上海微系統與信息技術研究所是我國著名的技術學科綜合性研究所之一，前身是成立于1928年的國立中央研究院工程研究所。 自建國以來，上海微系統所已獲得國家級獎勵46項、部委省級獎勵340余項。研究所在國內率先研制成功球墨鑄鐵，成功解決了包頭高含氟鐵礦的冶煉和稀土元素回收問題；研制成功用于濃縮鈾235的關鍵部件“甲種分離膜”，并獲“兩彈一星”功勛獎章；研制出國內第一塊高速超高速雙極型數字集成電路；利用微電子技術基礎開展了微電子機械系統和SOI材料的研究；開展了無線傳感器網絡和新一代移動通信技術的研究，為國民經濟發展、國家安全和社會進步做出了重大貢獻。
中國科學院上海硅酸鹽研究所
中國科學院上海硅酸鹽研究所（簡稱上海硅酸鹽所）淵源于1928年成立的國立中央研究院工程研究所，1953年更名為中國科學院冶金陶瓷研究所。1959年獨立建所，定名為中國科學院硅酸鹽化學與工學研究所，1984年改名為中國科學院上海硅酸鹽研究所。經過九十多年的發展，上海硅酸鹽所現已成為集材料前沿探索、高技術創新、應用發展研究為一體的無機非金屬材料科研機構，形成了“基礎研究—應用研究—工程化、產業化研究”有機結合的較為完備的科研體系。
中國科學院上海光學精密機械研究所
中國科學院上海光學精密機械研究所（簡稱：上海光機所）成立于1964年，是我國建立最早、規模最大的激光科學技術專業研究所。現已成為以現代光學重大基礎前沿探索、強激光科技裝置建設、激光與光電子系統開拓為重點的綜合性研究所。研究所重點學科領域為：強激光技術、強場物理與強光光學、空間激光與時頻技術、信息光學、量子光學、激光與光電子器件、光學材料等。
中國科學院上海應用物理研究所
中國科學院上海應用物理研究所（簡稱上海應物所）成立于1959年，原名中國科學院上海原子核研究所，2003年6月改為現名。擁有上海嘉定園區（約400畝）和甘肅武威園區（約1000畝）。上海應物所是國立綜合性核科學技術研究機構，以釷基熔鹽堆核能系統、高效能源存儲與轉換等先進能源科學技術為主要研究方向，同時兼顧核技術在環境、健康、材料領域的若干前沿應用研究，致力于熔鹽堆、釷鈾燃料循環、核能綜合利用等領域的關鍵技術研發。上海應物所的戰略定位是引領國際釷基熔鹽堆研發，成為國際領先的釷基熔鹽堆核能系統研究中心、原始創新策源地和科技人才高地，為我國能源長期穩定供應（能源獨立）和實現“雙碳”目標提供重要的解決方案。
中國科學院上海技術物理研究所
中國科學院上海技術物理研究所（簡稱上海技物所）創建于1958年10月，是集基礎研究、工程技術研發和高新技術產業化為一體的綜合型研究機構。上海技物所以紅外物理與光電技術研究為定位，重點發展空天紅外與光電有效載荷、紅外凝視成像及信號處理、紅外探測器、空間主動光電技術及遙感信息處理等技術。
中國科學院上海有機化學研究所
中國科學院上海有機化學研究所（簡稱：上海有機所）是集基礎研究、應用研究和高技術創新研究為一體的綜合性化學研究機構，創建于1950年5月，是中國科學院首批成立的15個研究所之一，前身是建立于1928年7月的前中央研究院化學研究所。從開展抗生素和高分子化學的研究起步，經過70多年幾代人艱苦創業、奮力拼搏，在以有機化學研究為中心的基礎研究、應用研究與高新技術開發、人才培養等方面均取得令人矚目的成就。在我國“兩彈一星”研制、“人工合成牛胰島素、人工合成酵母丙氨酸轉移核糖核酸”和“物理有機化學中的兩個基本問題：自由基化學中取代基離域參數和有機分子簇集概念”等一批攀登科技高峰的重要成果中，我所科研人員作出了重要貢獻。
中國科學院上海營養與健康研究所
中國科學院上海營養與健康研究所（以下簡稱營養與健康所）是我國重大慢病防控與老齡健康促進領域基礎與應用基礎研究機構，由中國科學院原上海生命科學研究院人口健康方向“三所一院兩中心”于2016年底整合組建，2019年獲批中編辦事業法人單位。 營養與健康所堅持“四個面向”，立足面向人民生命健康，圍繞“健康中國”戰略、 “積極應對人口老齡化”國家戰略等國家意志，對標“四個率先”“兩加快一努力”等國家要求，聚焦“重大慢病防控與老齡健康促進”國家需求，構建融“營養、大數據與信息、健康”為一體的建制化特色優勢，著力為“治未病”提供原創理論、干預策略、營養健康標準和解決方案。
中國科學院分子細胞科學卓越創新中心
中國科學院分子細胞科學卓越創新中心（簡稱分子細胞卓越中心）成立于2015年，依托中國科學院原上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所（簡稱生化與細胞所）建設及管理。2019年分子細胞卓越中心獲批國家事業單位法人。原生化與細胞所成立于2000年5月，由中國科學院原上海生物化學研究所與中國科學院原上海細胞生物學研究所整合而成。上海生物化學研究所的前身是1950年成立的中國科學院生理生化研究所“生化大組”，后于1958年獨立建所，名為生物化學研究所。上海細胞生物學研究所的前身是1950年成立的中國科學院實驗生物研究所“發生生理研究室”，1953年其他研究室獨立建所，發生生理研究室沿用實驗生物研究所名，直至1978年更名為上海細胞生物學研究所。
中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心
作為推動新千年基礎科學研究的重要戰略步驟和作為知識創新工程中的一個試點，中國科學院于1999年11月27日成立了神經科學研究所。神經科學研究所致力于神經科學基礎研究的各個領域，包括分子、細胞和發育神經生物學、系統和認知神經科學科學、以及腦疾病機理和診治手段研發。研究所的宗旨是建立一個現代化研究所的機制，提供一個有助于嚴謹科研工作，高效科研產出，良性科研合作的環境，實現以業績為準的激勵和資助評估系統，以及為研究生和博士后提供高質量的專業訓練。2014年起，神經科學研究所在中國科學院體制與機制改革的框架下，成為中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心(簡稱中國科學院腦智卓越中心)的依托單位。腦智卓越中心是跨學科、跨院校的組織（見另一網站:http://www.cebsit.ac.cn/）,旨在凝聚中國科學院內外的科研實力，通過團隊合作和學科交叉融合，解決在腦科學和類腦智能技術兩個前沿領域的重大問題。
中國科學院分子植物科學卓越創新中心
中國科學院分子植物科學卓越創新中心（簡稱“分子植物卓越中心”，下同）是中國科學院直屬的獨立事業法人科研機構，其前身是中國科學院上海植物生理生態研究所。1999年，原中國科學院上海植物生理研究所與原中國科學院上海昆蟲研究所整合成立中國科學院上海植物生理生態研究所。2016年，植物生理生態研究所依托分子植物卓越中心，設立中國科學院直屬科研機構。2019年，分子植物卓越中心獲批獨立事業法人資格。
中國科學院上海天文臺
中國科學院上海天文臺（簡稱上海天文臺）成立于1962年，其前身是1872年建立的徐家匯天文臺和1900年建立的佘山天文臺。目前上海天文臺包括徐家匯園區和佘山科技園區兩個部分，徐家匯為總部。天文觀測臺站位于上海松江佘山地區。上海天文臺以天文地球動力學、天體物理以及行星科學為主要學科方向，同時積極發展現代天文觀測技術和時頻技術，努力為天文觀測研究和國家戰略需求提供科學和技術支持。在基礎研究方面，擁有若干具有國際一流競爭力的研究團隊；在應用研究方面，上海天文臺在國家導航定位、深空探測等國家重大工程中發揮重要作用。
中國科學院上海藥物研究所
中國科學院上海藥物研究所前身是國立北平研究院藥物研究所，創建于1932年，次年遷至上海，2003年搬遷至浦東張江高科技園區，是我國歷史最悠久的綜合性創新藥物研究機構。現有職工1000余人，其中兩院院士4人，杰青等國家級高層次人才近200余人。在學博、碩士研究生及聯合培養研究生2000余人，在站博士后170人。
中國科學院福建物質結構研究所
中國科學院福建物質結構研究所（簡稱福建物構所）由我國著名科學家、教育家盧嘉錫院士于1960年創建，是中國科學院優秀研究所。經過60多年發展，獲得國家科技三大獎及中國科學院科技進步特等獎等260多項重要科技成果和獎勵，已成為在國際上具有重要影響力的結構化學、新材料與器件集成與應用的綜合研究基地。
中國科學院寧波材料技術與工程研究所
為加快國家和區域創新體系建設，發揮中國科學院作為科技國家隊的支撐引領作用，中國科學院、浙江省人民政府、寧波市人民政府三方領導高瞻遠矚，運籌帷幄，于2004年4月20日共同簽署了共建中國科學院寧波材料技術與工程研究所（簡稱寧波材料所）協議書。由此，實現了浙江省內中國科學院系統研究所“零”的突破，拉開了寧波材料所建設的序幕。創立以來，寧波材料所緊密結合國際科技發展趨勢和國家創新驅動發展需求，圍繞“材料研究”，先后布局了材料技術、材料+制造、材料+能源、材料+醫工4大領域。經過十幾年努力，已成為新材料及相關領域的重要研究基地和技術提供者。
中國科學院城市環境研究所
中國科學院城市環境研究所成立于2006年7月4日，是中國科學院下屬的事業法人單位，是目前國際唯一的專門從事城市環境綜合研究的國立研究機構，位于美麗的南方海濱城市—廈門市。研究所目前擁有“環境科學與工程”和“生態學”兩個一級學科的碩士、博士學位授予點，“資源與環境”碩士專業學位授予點，以及“環境科學與工程”博士后科研流動站、“生態學”博士后科研流動站。
中國科學院上海高等研究院
中國科學院上海高等研究院（以下簡稱“高研院”）是由中國科學院和上海市人民政府共建的科研機構，坐落于上海張江，2008年9月26日成立。 2017年3月，中國科學院與上海市圍繞建設具有全球影響力的科技創新中心簽訂了深化合作的補充協議，蛋白質設施和上海光源先后劃轉至高研院以支持上海科創中心建設，劃轉團隊包含了國內最齊整、綜合實力最強的大型先進光源裝置研發與工程建設隊伍。
中國科學院微小衛星創新研究院
中國科學院微小衛星創新研究院（以下簡稱“衛星創新院”）是我國微小衛星及相關技術領域的總體單位之一，主要從事小衛星、微、納、皮衛星及相關技術的科學研究、技術開發和科學實驗。作為我國科學衛星領域的主力軍、應用衛星領域的方面軍，已成功發射包括北斗三號組網衛星、暗物質粒子探測衛星、量子科學實驗衛星、天宮二號伴隨衛星、愛因斯坦探針衛星、中法天文衛星等129顆衛星。衛星創新院致力于成為我國先進衛星科學技術的創新引擎、航天科技成果轉化和產業化示范基地、政學研產用緊密結合的橋梁紐帶和國際交流合作的開放平臺，為國家戰略需求和重大科學突破提供有力支撐。
中國科學院杭州醫學研究所
中國科學院杭州醫學研究所（醫學所）成立于2019年5月8日，由中國科學院與浙江省人民政府合作共建，是中國科學院首個以醫學命名的直屬研究機構，也是浙江省重點引進和打造的生命健康科創高地主平臺。2023年2月23日，醫學所獲批設立為中央事業法人單位。2024年1月25日，中國科學院杭州醫學所正式掛牌，進入高質量發展新階段。
中國科學院聲學研究所東海研究站
中國科學院聲學研究所東海研究站又名上海聲學實驗室，始建于1960年，隸屬于中國科學院聲學研究所。東海研究站主要從事水聲導航技術、水聲定位技術、水聲探測技術、超聲應用技術、數字通訊及信息處理技術和醫療聲學技術等領域的研究和開發。
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